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04叶绿体流程1-组装
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进化树
06进化树流程-分歧时间
06进化树流程-常规
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0800转录组流程0-rna编辑
重测序与简化
06KASP流程-通用-有参重测序&简化 or 无参简化
06T-DNA（外源基因）插入位点
07重测序流程1-常规有参
07重测序流程2-遗传进化
08简化测序流程1-有参ddrad
08简化测序流程2-无参ddrad
09基于snp的遗传多样性
09核心种质流程
10渐渗片段、标记开发
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细胞器组装 -- 三代数据 -- Canu v2.3
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细胞器组装 -- 二三代植物线粒体 -- GSAT - Graph-based Sequence Assembly Toolkit
细胞器组装 -- 二代数据 -- Getorganelle
细胞器组装 -- 细胞器 -- spades
340-群体遗传学
vcf文件相关操作
00VCF文件
01vcf挑选指定区间、指定样本、去除无差异行
高效替换VCF文件染色体名
参考基因组相关操作
01基因组提取指定区间 - 保留最长200条 - 修改序列名称 - 批量提取指定染色体
01查找参考基因组
02gff提取指定区间
10单倍型分析
10群体遗传进化分析详解
350-进化树
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进化树构建 -- NJ法 -- rapidnj
进化树美化 -- web -- Evolview
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